Kluczowa różnica między CRISPR i CRISPR Cas9 polega na tym, że CRISPR (zgrupowane regularnie rozmieszczone krótkie powtórzenia palindromiczne) jest naturalnie występującym prokariotycznym mechanizmem obrony immunologicznej, podczas gdy CRISPR cas9 jest nukleazą Cas9 kierowaną przez RNA, która jest częścią adaptacyjnego układu odpornościowego CRISPR.
CRISPR to przeciwwirusowy system odpornościowy występujący w bakteriach i archeonach . Jest to rodzina sekwencji DNA występujących w genomie bakterii. Składa się z sekwencji odstępnika, które pochodzą z fragmentów DNA bakteriofagów , które wcześniej je zainfekowały. W kolejnych infekcjach wirusowych bakterie wykorzystują te sekwencje do niszczenia wirusowego DNA. Sekwencje CRISPR mają krótkie powtórzenia palindromiczne i sekwencje odstępnika. Ponadto sekwencje odstępnika powtórzeń CRISPR często mają powiązane geny, które kodują białka Cas. Cas9 jest endonukleazą kierowaną przez RNA. Wraz z sekwencjami CRISPR białko Cas9 działa jako adaptacyjny układ odpornościowy bakterii przeciwko bakteriofagom.
ZAWARTOŚĆ
1. Przegląd i kluczowa różnica
2. Co to jest CRISPR
3. Co to jest CRISPR Cas9?
4. Podobieństwa między CRISPR i CRISPR Cas9
5. Porównanie obok siebie – CRISPR vs CRISPR Cas9 w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie
Co to jest CRISPR?
CRISPR to skrót od Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Jest to skupisko sekwencji DNA znajdujących się w genomie bakterii. Działa jako naturalny mechanizm obronny u bakterii i został po raz pierwszy zidentyfikowany w E. coli . U bakterii działa jako adaptacyjna ochrona immunologiczna, zwłaszcza przed bakteriofagami. Dlatego jest to mechanizm specyficzny dla sekwencji.
Rysunek 01: CRISPR
System CRISPR zawiera kilka krótkich sekwencji powtórzeń DNA. Te powtórzenia są palindromiczne, mają tę samą sekwencję zasad przy odczycie od 5' do 3', podczas gdy druga daje taką samą sekwencję przy odczycie od 3' do 5'. Co więcej, powtórzenia są identyczne. Znajdują się one pomiędzy krótkimi „przerywnikowymi” sekwencjami DNA, które nie są identyczne. Ale te sekwencje odstępnika są podobne lub pasują do obcego DNA bakteriofaga. Geny związane z CRISPR są znane jako geny związane z CRISPR lub geny Cas. Geny Cas kodują białka Cas, które są helikazami lub nukleazami. Helikazy rozwijają DNA, podczas gdy nukleazy przecinają DNA. Ogólnie rzecz biorąc, biorąc pod uwagę CRISPR, jest to układ odpornościowy bakterii, który działa przeciwko bakteriofagom (bakterie infekujące wirusy).
Co to jest CRISPR Cas9?
Białko 9 związane z Cas9 lub CRISPR jest bakteryjną endonukleazą sterowaną przez RNA. Jest to zatem enzym, który rozpoznaje i przecina docelowy DNA (zwłaszcza DNA bakteriofaga) komplementarny do kierującego RNA. Wykonuje rozszczepienie specyficzne dla pasm. Białko Cas9 jest kodowane przez gen związany z CRISPR. CRISPR cas9 to sterowany przez RNA system nukleazy CRISPR-Cas9, który może być używany jako programowalna platforma celowania i edycji DNA do edycji genomu, zaburzeń transkrypcyjnych, modulacji epigenetycznej i obrazowania genomu. Ten system CRISPR cas9 jest bardzo popularny w obecnych systemach edycji genomu.
Rysunek 02: CRISPR Cas9
Obecnie system CRISPR/Cas9 jest używany do zmiany lub modyfikacji genomu ssaka poprzez represję transkrypcji lub aktywację. Komórki ssaków mogą reagować na pęknięcia DNA, w których pośredniczy CRISPR/Cas9, poprzez zastosowanie mechanizmu naprawczego. Można to zrobić przy użyciu niehomologicznej metody łączenia końców (NHEJ) lub naprawy ukierunkowanej na homologię (HDR). Oba te mechanizmy naprawcze odbywają się poprzez wprowadzenie dwuniciowych przerw. Powoduje to edycję genów ssaków. NHEJ może prowadzić do ablacji mutacji genów i może być wykorzystana do wywołania utraty efektów funkcji. HDR może służyć do wprowadzania określonych mutacji punktowych lub wprowadzania segmentów DNA o różnej długości. Obecnie system CRISPR/Cas jest wykorzystywany w zastosowaniach terapeutycznych, biomedycznych, rolniczych i badawczych.
Jakie są podobieństwa między CRISPR a CRISPR Cas9?
- Cas9 jest częścią systemu CRISPR Cas.
- Crisper cas9 system to układ odpornościowy naturalnie występujący w bakteriach.
Jaka jest różnica między CRISPR a CRISPR Cas9?
CRISPR to grupa sekwencji DNA znajdujących się w genomie bakterii, która działa jako naturalny system obronny przed bakteriofagami. Składa się z regularnie rozmieszczonych krótkich powtórzeń palindromicznych, przerywników i powiązanych genów. W przeciwieństwie do tego, cas9 jest białkiem 9 związanym z CRISPR, które jest enzymem endonukleazy kierowanej przez RNA. Rozpoznaje i rozcina podwójne nici DNA wirusów. W rzeczywistości jest częścią systemu obronnego CRISPR. Jest to więc kluczowa różnica między CRISPR a CRISPR cas9.
Podsumowanie – CRISPR vs CRISPR Cas9
System CRISPR Cas jest mikrobiologicznym systemem obrony. CRISPR to klaster sekwencji DNA składający się z krótkich powtórzeń palindromicznych, sekwencji rozdzielających i powiązanych genów. Cas9 to jedno białko Cas, które jest endonukleazą kierowaną przez RNA. Białko CRISPR i Cas9 tworzą układ odpornościowy, który działa przeciwko infekcjom bakteriofagowym u bakterii. Białko Cas9 jest w stanie przecinać obcy wirusowy DNA i je niszczyć. CrRNA kieruje cas9 do rozpoznawania wirusowego DNA. Dlatego system CRISPR cas9 jest naturalnym układem odpornościowym bakterii przeciwko wirusom. Jest to zatem podsumowanie różnicy między CRISPR a CRISPR cas9.
Referencja:
1. Jiang, Fuguo. „Struktury i mechanizmy CRISPR-Cas9”. Roczne recenzje , dostępne tutaj .
Zdjęcie dzięki uprzejmości:
1. „4QYZ”. Autor: Boghog – Praca własna (CC BY-SA 4.0) przez Commons Wikimedia
2. „GRNA-Cas9” „Autor Marius Walter – Praca własna (CC BY-SA 4.0) przez Commons Wikimedia
